Hiện nay độ mặn đo được ở các con sông trên địa bàn huyện Chợ Lách đã giảm đáng kể, tại Vàm Mơn xã Phú Sơn độ mặn đo được dao động khoảng 0,1-0,5‰, tại phà Tân Phú không còn mặn. Tuy nhiên trước đó do ảnh hưởng nước mặn dâng cao làm cho diện tích 8 ngàn héc ta đất nông nghiệp trong toàn huyện bị nhiễm mặn. Trong đó bao gồm diện tích trồng cây ăn trái, cây giống, hoa kiểng, …nhưng thiệt hại nặng nề nhất là những hộ sản xuất cây giống vì các cây này có bộ rễ còn non rất mẫn cảm với nước mặn nên dễ chết, cháy lá.